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  • 免疫研究新启示—蛋白修饰+转录因子

    先天淋巴细胞组3(ILC3s)可以通过促进淋巴器官和增强免疫反应来抵抗细菌感染。有研究表明ILC3谱系受转录因子调控,同时前期研究也发现谷氨酰化参与免疫应答的调节,但转录因子和谷氨酰胺化如何调节ILCs的发育和维持还不是很清楚。中国科学院生物物理所范祖森课题组在国际学术期刊《Nature Communication》上在线发表了一项名为< IL-7Rα glutamylation and activation of transcription factor Sall3 promote group 3 ILC development >的研究论文,发现IL-7Rα可以被TTLL4和TTLL13谷氨酰化,并被CCP2去谷氨酰化。IL-7Rα的谷氨酰化促进STAT5激活启动转录因子Sall3的表达,最终促进ILC3s的发生。IL-7Rα的谷氨酰化和去谷氨酰化严密控制着ILC3s的发展和效应功能。

    0 2017-08-31
  • 《Cell Stem Cell》:lncTCF7通过激活Wnt通路调控肝癌

    LncRNA介导的生物学已经牵涉于许多细胞过程。在癌症中,lncRNAs可作为转录调控因子与染色质重塑复合物(SWI / SNF复合物)协作发挥功能。SWI/ SNF复合物参与哺乳动物干细胞自我更新和分化过程。然而,肿瘤干细胞中SWI / SNF复合物功能是什么仍然不太清楚。中国科学院生物物理所的范祖森研究员带领的研究小组在国际学术期刊《Cell Stem Cell》上在线发表了一项名为< The Long Noncoding RNA lncTCF7 Promotes Self-Renewal of Human Liver Cancer Stem Cells through Activation of Wnt Signaling >的最新研究论文,首次发现了一个新的非编码RNA—— lncTCF7, 它可以募集SWI / SNF复合物到TCF7的启动子区域来调节其表达,从而激活Wnt信号通路,进一步促进肝癌干细胞的自我更新。

    0 2017-08-31
  • Affymetrix芯片数据的GEO上传攻略!

    最近有客户咨询GEO数据上传问题,问题都比较细,今天小编主要针对Affymetrix芯片数据如何上传整理了一份操作指南。有需要的小伙伴可以参考一下!
    客户在我们公司做完Affymetrix高通量芯片检测后,从我们这里得到数据结果,结果排布如下图所示,其中需要在GEO数据库上传的数据包括两部分:1是原始文件(.cel);2是标准化文件(.txt)。

    0 2017-08-31
  • HT-BSP助力表观遗传学研究!

    目前,大家研究比较普遍集中在DNA甲基化检测上,如检测某一个或几个基因的甲基化水平,这时采用高通量甲基化芯片或测序,通量太高,过于浪费;而采用传统的焦磷酸测序、T-BSP、MSP一次性只能检测个别甲基化位点,麻烦费事,也不合适。这时候HT-BSP应运而生,可以检测多个基因任何位置的甲基化水平,既适用于一些甲基化检测区域已知的基因,也适用于探索基因的显著甲基化区域目前,大家研究比较普遍集中在DNA甲基化检测上,如检测某一个或几个基因的甲基化水平,这时采用高通量甲基化芯片或测序,通量太高,过于浪费;而采用传统的焦磷酸测序、T-BSP、MSP一次性只能检测个别甲基化位点,麻烦费事,也不合适。这时候HT-BSP应运而生,可以检测多个基因任何位置的甲基化水平,既适用于一些甲基化检测区域已知的基因,也适用于探索基因的显著甲基化区域

    0 2017-08-31